• Odjel sigurnosti prometa i upravno-pravnih poslova obavlja upravno-pravne i druge stručne poslove u svezi izrade nacrta i prijedloga sustavnih zakona i drugih propisa iz upravnog područja cestovnog prometa, cesta i sigurnosti prometa na cestama, neposredne provedbe zakona i međunarodnih propisa, donošenja propisa za njihovu provedbu, upravnog postupka, upravnog nadzora, pračenje stanja i predlaganja poduzimanja odgovarajućih mjera kao administrativno stručne poslove vezane za uspješno funkcioniranje Hrvatskog savjeta za sigurnost prometa na cestama.

• Odjel za javne ceste sudjeluje u pripremi i koordinira Strategiju razvitka javnih cesta, koordinira, izrađuje i predlaže Vladi Republike Hrvatske četverogodišnje programe građenja i održavanja javnih cesta, koordinira i prati cjelovitost sustava javnih cesta, provodi prvostupanjski upravni postupak, provodi upravni nadzor, provodi upravne i druge stručne poslove koji se odnose na razvoj, planiranje, građenje i održavanje javnih cesta, sudjeluje u radu međunarodnih organizacija iz područja cesta te radu stručnih društava, daje stručna mišljenja iz područja planiranja, razvoja, građenja i održavanja javnih cesta, prati izradu studija i projekata građenja i održavanja javnih cesta uključujući i učešće u upravnom postupku građenja cesta od lokacijske do uporabne dozvole, sudjeluje u koncipiranju prometnih, prostornih i urbanističkih planova na svim razinama, prati razvoj auto-cestovnog sustava i naplate cestarina, sudjeluje u pripremi financiranja, razvoja i održavanja javnih cesta i usklađivanja s državnim proračunom, surađuje sa Hrvatskom upravom za ceste, Županijskom upravom za ceste te projektnim i izvođačkim pravnim osobama, prati prometne tokove i usmjerava poboljšanja u domeni izgradnje i održavanja, sigurnosti prometa i zaštite okoliša javnih cesta, koordinira izradu stručnih pravilnika, normi i standarda za projektiranje, izgradnju i održavanje javnih cesta, obavlja i druge poslove koji proizlaze iz prirode posla odnosno naloga ministra, a odnose se na javne ceste.

• Odjel za cestovni prijevoz vodi prvostupanjski upravni postupak iz nadležnosti Odjela, provodi upravni nadzor, obavlja stručne poslove iz područja cestovnog prijevoza, daje stručna mišljenja i objašnjenja iz područja cestovnog prijevoza, priprema i provodi dvostrane i višestrane međunarodne ugovore koji se odnose na cestovni prijevoz, izrađuje akte o provođenju dvostranih i višestranih međunarodnih ugovora, priprema i usaglašava domaće zakonodavstvo s međunarodnim standardima, prati i analizira stanje gospodarskih subjekata u cestovnom prijevozu, te priprema i izrađuje izvješća, obavlja i druge poslove koji proizlaze iz prirode posla odnosno naloga ministra, a odnose se na cestovni prijevoz.

• Uprava željezničkog prometa provodi upravne i druge stručne poslove koji se odnose na željeznice, priprema nacrte prijedloga zakona i drugih propisa iz područja željezničkog i kombiniranog prometa, priprema nacrte podzakonskih akata za djelatnost željeznice, daje suglasnosti na opće akte koji se donose temeljem zakona, utvrđuje posebne uvjete i daje suglasnosti na tehničku dokumentaciju za građenje željezničkih pruga, glede tih posebnih uvjeta, sudjeluje u radu komisija za tehnički pregled prototipa željezničkog vozila i izdaje odobrenje za upotrebu, daje prijedloge o razvrstavanju željezničkih pruga, daje odobrenje za ukidanje vlakova za prijevoz putnika, daje ovlast za obavljanje tehničkog pregleda serijskog vozila, sudjeluje u radu komisija za tehnički pregled pruga i objekata od značaja za Republiku Hrvatsku, izrađuje nacrte prijedloga zakona i uredbi o ratifikaciji međunarodnih ugovora koji se odnose na željeznički i kombinirani promet, izrađuje prijedloge međudržavnih sporazuma odnosno ugovora koji se odnose na željeznički i kombinirani promet, sudjeluje u međunarodnim tijelima i komisijama za željeznički i kombinirani promet, sudjeluje u predlaganju politike razvoja željezničkog i kombiniranog prometa, sudjeluje u pripremi podloga za izradu državnog proračuna, priprema upute i smjernice za izradu planova izgradnje, osuvremenjivanja i održavanja željezničkih stabilnih postrojenja, prati realizaciju planova izgradnje, osuvremenjivanja i održavanja željezničkih stabilnih postrojenja, priprema izvješća o stanju željezničkog prometa i ostvarivanju planova razvoja, osuvremenjivanja i održavanja željezničke infrastrukture, prati stanje u poslovanju Hrvatskih željeznica, putem izvješća o poslovanju, prati tehničko i funkcionalno stanje željezničke infrastrukture, sudjeluje u pripremi podloga za utvrđenje visine naknade za korištenje željezničkih stabilnih postrojenja, sudjeluje u pripremi podloga za ocjenjivanje rentabilnosti pruga i utvrđivanje naknade troškova željezničkog prijevoza na prugama na kojima se od prihoda ne mogu pokriti ukupni troškovi prijevoza, sudjeluje u pripremanju podloga za utvrđivanje prijevoza po povlaštenoj cijeni, sudjeluje u izradi nacrta prijedloga zakona i drugih propisa iz ostalih prometnih grana u dijelu koji se odnosi na kombinirani prijevoz, prati i analizira stanje, poslovanje i razvoj gospodarskih subjekata koji obavljaju kombinirani prijevoz,priprema prijedloge mjera i rješenja za razvitak i poboljšanje rada u kombiniranom prijevozu, organizira međugransku suradnju za razvoj kombiniranog prijevoza, provodi i osigurava primjenu zakona i ostalih propisa u oblasti željeznica i kombiniranog prijevoza, obavlja i druge poslove koji proizlaze iz prirode posla odnosno naloga ministra, a odnose se na željeznički i kombinirani promet.

• Za obavljanje poslova Uprave željezničkog prometa ustrojavaju se sljedeći odjeli:

• Odjel željezničke infrastrukture obavlja upravno pravne i druge stručne poslove koji se odnose na željezničku infrastrukturu, a u svezi izrade nacrta prijedloga sustavnih propisa, neposredne primjene zakona i međunarodnih propisa, donošenja propisa za njihovu provedbu, upravnog nadzora, pračenja stanja, izrade stručnih podloga i prijedloga poduzimanja odgovorajućih mjera.